自考本科报了名后是可以更换院校的，而且无需办理什么手续，只要按原考试计划进行考试并在毕业申请时选择心仪的院校即可。若考生是既需要换专业又需要更换主考院校的，需要持本人准考证、课程合格证书到所在地的市、县(区)提出申请和填写转考专业登记表，并经自考办签署意见后方可改报专业。
自考难度跟院校专业科目设置上关系较大，首先每一个自考专业只会对应一所主考院校，即使是专业相同，考试科目也会因为主考院校不同而有差别。拿汉语言文学专业来举例，在北师大汉语言文学专业要考汉字学、传播学概论、心理学等，而南师大则是考鲁迅研究、中国文化概论。光从考试科目设置来看，就能分辨出其难度的差异。这种难易程度差异还体现在各个主考院校的论文答辩环节。
教育部曾经对自考成绩有效期有过规定：单科成绩8年有效。但是，自考单科成绩8年有效并不是硬性规定，教育部将是否操作此规定的选择权给予了各省。目前已经执行自考成绩8年有效期的的省市有：黑龙江、陕西、江西、辽宁、河南等。像北京、上海、山东、江苏、河北、浙江、新疆、广东、湖南尚未执行此规定。
